酶工程是生物技术专业的选修课，通过本课程的学习，使学生在微生物学、生物化学、遗传学、细胞生物学，以及发酵工程、基因工程和细胞工程的基础上系统掌握酶工程的基本原理、基本知识和基本技能，掌握酶的分离、提取、精制方法，理解酶催化特性及酶催化动力学，了解酶在不同行业中的应用，以及现代酶工程理论和技术的新发展，建立较为深刻的微生物学观点，形成科学的思维方式。蛋白质工程是20世纪80年代初诞生的一个新生生物技术领域，它一出现就以其在应用上的广阔前景和对分子生物学有关前沿研究的巨大推动而为世人瞩目，受到学术界和产业界的广泛重视。蛋白质工程就是利用生物技术手段对蛋白质的DNA编码序列进行有目的的改造并分离、纯化蛋白质，从而获得自然界没有达到、具有优良性质或适用于工业生产条件的全心蛋白质的技术。由于蛋白质工程是在基因工程的基础上发展起来的，在技术上有诸多同基因工程相似的地方，因此蛋白质工程也被成为"第二代基因工程"。蛋白质工程在生物工程领域占有重要地位，是生物工程专业的必修课。其主要内容包括基因水平上的蛋白质改造和蛋白质修饰。